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Technologie Sequenom® iPLEX® Gold

Technologie de génotypage Sequenom® iPLEX® Gold

  • Analyse entre 5 et 400 loci (SNP et indel) en parallèle
  • Génotypage personnalisé pour étudier des régions d'intérêt précises chez n'importe quelle espèce

Applications

  • Études de gènes candidats
  • Validation de découverte de SNP (SNP discovery validation)
  • Cartographie fine (fine-mapping) de régions d'association candidates
Description

La technologie de génotypage Sequenom® iPLEX® Gold est idéale pour les projets de moyenne envergure (études de validation de SNP et cartographie fine) lorsque de 5 à 400 marqueurs bi-alléliques tels des SNP et des indel (polymorphismes d'insertion/délétion) doivent être génotypés sur des centaines ou milliers d'échantillons d'ADN. L'avantage majeur de cette technologie est sa flexibilité puisqu'il n'existe aucune restriction quant au type de SNP qu'on peut y soumettre. Chaque panel peut contenir jusqu'à 36 marqueurs.

La réaction de génotypage est basée sur une PCR en multiplexe suivie d'une extension en simple base dirigée par une sonde (template-directed single base extension - SBE). Les produits d'extension sont ensuite séparés et détectés par spectrométrie de masse (MALDI-TOF MS). Selon les projets, le taux de conversion d'essai moyen est d'environ 85%. Le taux de réussite du génotypage est d'environ 92%, avec un taux d'erreur de moins de 0,1%.

Pour de plus amples détails, voir: Ehrich et al., 2005 Nucl Acids Res 33:e38 ou le site web de Sequenom®.

Produits disponibles

Le design d'essais personnalisés (custom design) est exclusivement réalisé par notre personnel.

Informations et demande de service

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