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Technologie de puces à adn d'affymetrix

Les biopuces à ADN GeneChip® permettent de mesurer quantitativement et qualitativement l'expression des produits de transcription. Le principe de fabrication des puces à ADN Affymetrix est la synthèse in situ de centaines de milliers de séquences distinctes d'oligonucléotides sur une matrice de verre, fixées par photolithographie et chimie combinatoire. Chaque oligonucléotide de 25 bases est reproduit à des millions d'exemplaires dans une région circonscrite. Chaque séquence de transcription est couverte par 11 à 20 paires de sondes d'oligonucléotides espacées aléatoirement sur la matrice. Toutes les séquences incluses sur la matrice sont sélectionnées à partir de GenBank, dbEST et RefSeq. Les ARN cibles sont transcrits en ADNc par transcriptase inverse, puis une transcription in vitro est menée pour créer de l'ARNc marqué à la biotine pour hybridation. L'ARNc cible hybridé est coloré à la streptavidine-phycoérythrine, puis les biopuces sont analysées avec un module de criblage GeneArray à une longueur d'onde de 488 nm. L'émission de lumière à une longueur d'onde de 570 nm est proportionnelle à la quantité de cible liée à chaque position des oligonucléotides sur la puce GeneChip®.

Des puces à ADN sont actuellement disponibles pour de nombreux organismes modèles utiles.

Pour de plus amples renseignements sur les biopuces, consultez le site Web d'Affymetrix.