Nouveaux prix de services à la baisse en vigueur le 1er septembre 2017. Contactez-nous à infoservices@genomequebec.com pour plus de détails.

Rendez-Vous Génome Québec 2012 - Deux événements (archives)

Lieux: Présentations:
jeudi, 6 décembre 2012
Université McGill New Residence Hall
3625 Avenue du Parc, Montréal

Ateliers:
vendredi, 7 décembre 2012
Université McGill Trottier Building
3630 rue University, Montréal

Date: 6 et 7 décembre 2012

Inscription:
  • Pour vous inscrire aux présentations suivez ce lien lien.
  • Pour vous inscrire aux ateliers suivez ce lien lien.
Présentations - 6 décembre

L'évolution des technologies a ouvert la porte à une foule d'applications en génomique, en faisant un champ de recherche très stimulant. Venez découvrir ce sur quoi les chercheurs travaillent.


Conférencière vedette: Dr Terry-Lynn Young, Ph.D.
Associate Professor
Memorial University of Newfoundland


Titre: A clan genomics approach to understanding human disorders: The Newfoundland experience and prospects
Conférencier vedette: Dr Mehrdad Hajibabaei, Ph.D.
Associate Professor
Biodiversity Institute of Ontario


Titre: Next-generation Sequencing technologies to study biological diversity from genes to ecosystems

Cet événement ce tiendra au New Residence Hall de l'Université McGill
New Residence Hall, 3625 Avenue du Parc, Montréal

jeudi, 6 décembre 2012

Les présentations seront en anglais.
Inscription, lunch et rafraichissements gratuits.

Horaire final
jeudi 6 décembre 2012
08h00 Inscription et petit déjeuner
08h25 Mot de bienvenue
Marc LePage,
président-directeur général,
Génome Québec
08h30 Keynote Speaker
A clan genomics approach to understanding human disorders: The Newfoundland experience and prospects
Terry-Lynn Young, Ph.D.
Memorial University of Newfoundland, St. John's
09h15 TBD
Stéphanie Roumy, Illumina
09h30 Ion Proton ? Single day workflows enabling an array of applications; from transcriptome profiling and characterization to whole genome sequencing.
Alexander Robertson, Life Technologies
09h45 Improving fruit and wine: how genomics can help
Sean Myles, Ph.D.
Dalhousie University, Halifax
10h15 Pause café (Pacific Biosciences et Sequenom)
10h35 Axiom: Enabling the next wave of genotyping: Biobanks, INDELS and rare variants
Alex Forrest-Hay, Affymetrix
10h50 Single cell genomics using nano-fluidics
Dan Clutter, Fluidigm
11h05 New Developments Next-Generation Sequencing
Ken Dewar, Ph.D.
McGill University, Montréal
11h35 Déjeuner
13h15 Conférencier-vedette
Next-generation Sequencing technologies to study biological diversity from genes to ecosystems
Mehrdad Hajibabaei, Ph.D.
Biodiversity Institute of Ontario, Guelph
14h00 TDB
Willem Haagmans, Roche
14h15 FORGE Canada - A National Initiative to Characterize Rare Genetic Disorders
Mark Samuels, Ph.D.
Université de Montréal, Montréal
14h45 Clôture du Rendez-Vous
Next-Generation sequencing analysis - 7 décembre

Conférencier: Guillaume Bourque, Ph.D.
Directeur bioinformatique
Centre d'innovation Génome Québec et Université McGill

Cet événement ce tiendra sur le Campus de l'Université McGill
au Pavillon Leacock Salle 232, 855 rue Sherbrooke Ouest Montreal

vendredi, 7 décembre 2012 - 9h00-10h00

La présentation et les ateliers seront en anglais.
Inscription, lunch et rafraichissements gratuits.

These Workshops are intended for scientists interested in the processing and the interpretation of high-throughput "omics" data. The objective is to familiarize people with methods and tools to analyze and integrate large-scale data sets.

The hands-on workshops that will be given are:

Ateliers - 7 décembre

Workshop Next-generation sequencing data (Whole genome/exome sequencing) - COMPLET

S.V.P. prendre note que toute annulation doit être effectuée au moins 48 heures avant la tenue de l'événement. à défaut d'annuler dans le délai prescrit ou en cas d'absence du participant lors de l'événement, des frais de 50$ seront facturés à l'investigateur principal du participant


Talk topics:
  • Read trimming
  • Aligning the reads to the genome reference
  • Marking duplicates
  • Compute metrics and generating coverage track
  • Single Nucleotide Variant calling
  • Structural variant calling
  • Copy number variant calling

Location: Pavillon Trottier de l'Université McGill
Date: 7 décembre 2012
Time: 10h30 to 12h30
>> Matériel de présentation

Workshop Next-generation sequencing data (RNA-Seq, Methyl-Seq, ChIP-Seq) - COMPLET

This workshop is geared towards biologists or bioinformaticians working with next generation sequencing datasets. Minimal unix knowledge is recommended, but step by step computational procedures will be performed live with support. Pipelines will be running on the Mammouth2 compute canada cluster with scaled down datasets using temporary accounts.

Talk topics:
  • RNA-Seq - De novo isoform discovery and differential transcript expression analysis
  • Methylation-Seq - Reduced region bisulfite sequencing and differential methylation region analysis
  • ChIP-Seq - Narrow (transcription factor) vs wide (histone marks) peak calling. Peak statistics, annotation and motif discovery.

Location: Pavillon Trottier de l'Université McGill
Date: 7 décembre 2012
Time: 10h30 to 12h30
>> Matériel de présentation
Pour de plus amples informations

Veuillez communiquer avec:

Frédérick Robidoux
frobidoux@genomequebec.com
Tel: 514 398-7211 #3
Fax: 514 398-1790

 

Merci à tous nos partenaires!